Principaux équipements acquis
Charte d'utilisation
- Les personnels des plateformes et laboratoires ayant accueilli un équipement financé par le projet Resist-omics sont susceptibles de participer à l’écriture de publications scientifiques.
- Leur inscription parmi les auteurs s’inscrit dans les recommandations pour la signature des articles scientifiques dans le domaine des sciences de la vie et de la santé (2019, Aviesan).
- Les plateformes accueillant un équipement et mettant à disposition un(des) personnel(s) seront a minima citées dans les remerciements.
- L’origine du financement de l’équipement fait l’objet d’une publicité dans les locaux dans lequel il est installé et sur l’ensemble des supports de communication.
- La page dédiée aux éléments de communication du CPER Resist-omics (logos, modèle de remerciements)
- La charte d'utilisation des équipements (PDF, 348ko)
Equipements
Spectromètre de masse
Le TOF-MS timsTOF fleX (Brucker) offre une solution adéquate pour les stratégies d'Omics spatiales à grande échelle guidées par l'imagerie MALDI-MS. Il est le seul appareil du marché permettant de réaliser à la fois des analyses protéomiques avec un grande sensibilité et à grande échelle et de l'imagerie MALDI-MS avec une résolution jusque à la cellule unique (5 µm) sur un même équipement.
Contact : Plateforme OrganOmics du Laboratoire PRISM Inserm U1192
Microscope confocal
Le microscope confocal LSM 980 (Zeiss) est intégré dans un système d'imagerie multimodale qui permet une continuité de résolution depuis la résolution obtenue en microscopie de florescence plein champ à la résolution obtenue en microscopie de type STED.
➣ Laser additionnel 730nm + détecteur NIR-GasAsP = 5 couleurs
➣ Airy scan 2 = haute résolution confocal (4Y, SR)
➣ LSM Plus
➣ Logiciel Zen optimisé pour l’imagerie en mosaïque rapide = imagerie d’échantillons larges
Contact : Plateforme d'imagerie cellulaire et tissulaire - BioImaging Center Lille (BICeL) - PLBS- UAR 2014 - US 41
Cytomètres spectraux trieurs de cellules
2 FACS-Trieurs Aurora CS (Cytek) sont installés sur les plateaux des Campus Pasteur Lille et Santé.
L’achat de ces deux équipements a permis de structurer un plateau de cytométrie spectrale de pointe au plus proche des besoins des utilisateurs. Ces cytomètres de dernière génération permettent des approches sur cellule unique, pour la détection et le tri de sous-populations cellulaires existantes tout comme l'identification de nouvelles populations cellulaires.
➣ capacité de détection minimale de 25 parmètres de fluorescence avec 5 lasers
➣ installation sous hotte de protection PSM-II supplémentaire pour le site de Pasteur permettant spécifiquement la manipulation des échantillons infectieux ou OGM de type 2.
Contact : Plateforme d'imagerie cellulaire et tissulaire tissulaire - BioImaging Center Lille (BICeL) - PLBS- UAR 2014 - US 41
Analyse unicellulaire à haut débit
L'acquisition de 2 Single-cell RNA-Seq- Chromium (10X Genomics) permet l’analyse de milliers de cellules en parallèles au niveau transcriptomique tout en quantifiant des marqueurs protéiques de surface. Ce type d'appareil permet à la fois de travailler sur cellules fraiches mais aussi fixées donnant accès à l’étude d’un plus grand nombre d’échantillons. Il permet également de multiplexer les échantillons, soit à l’aide de la technologie OCM (On-Chip-Multiplexing), soit en technologie flex, permettant de faire baisser les coûts expérimentaux par échantillon.
Contact : Plateforme de génomique Go@L - PLBS- UAR 2014 - US 41
Plateforme de nanodistribution automatisée
Cette station de travail automatisée (Biomek-ECHO) permet une nanodistribution, avec chargement automatisé des plaques de format variable essentiellement 96 et 384 puits.
Dans cette station, l'acquisition du nanodistributeur ECHO650 permet le transfert des nanogouttes de liquide par énergie acoustique. Cette technologie améliore la précision et l’exactitude des résultats scientifiques tout en diminuant les volumes de réactifs nécessaires, ainsi qu’en éliminant le besoin de certains consommables plastique (système sans cônes). Le confinement biologique est assuré par une hotte à flux laminaire de classe II, HBox.
Contact : Plateforme ARIADNE criblage - Criblage à haut débit et haut contenu - PLBS - UAR 2014 - US 41
